BRT二号线主要采取“一主两支一区间”的线路运营方案：“一主”即B2路，从西林公交中心站始发，经中吴大道、怀德南路、怀德中路、延陵西路、延陵中路、丽华北路、东方西路、东方东路至戚区公交中心站。“两支”，一条是沟通火车站与花园客运站的主干线B22路，由花园公交中心站，经怀德南路、延陵西路、北大街、局前街、鹤园路、北太平路、关河路至火车站；另一条是B23路，按原9路线走向，从钟楼区童子河路公交站始发，至虹景金桂园。同时，为解决B2线高客流段的乘客出行，还新辟B2线区间线路B21路，从西林公交中心站始发，沿B2线至延陵中路，单向环绕文笔塔路、武青路至红梅公交中心站，上行经洗米弄、延陵中路后原线返回。